Les bactériophages sans queue contenant de l'ADN n'ont pas pu être détectés par les méthodes standard - mais les scientifiques pensent maintenant qu'ils dominent les océans du monde.
Chaque goutte d'eau pas trop profonde de la surface de la mer contient environ 10 millions de virus. Il n'est pas étonnant que les biologistes en découvrent constamment de nouveaux, même si la découverte d'un tout nouveau groupe est encore très rare. Il semble que les techniques standard ne permettent tout simplement pas de les remarquer, bien que ces virus se soient avérés extrêmement nombreux - peut-être qu'ils sont répandus non seulement dans l'océan et ont tout simplement échappé aux scientifiques.
Martin Polz du Massachusetts Institute of Technology et ses collègues ont examiné des échantillons d'eau prélevés au large de la côte nord-américaine de l'océan Atlantique. Ils ont recherché des virus contenant de l'ADN double brin - ces virus sont extrêmement répandus, y compris l'herpès et le bactériophage T4 (Caudovirales) familier à tout le monde à l'école. En infectant des cultures de bactéries marines Vibrionaceae, les scientifiques ont découvert 200 virus à ADN différents, dont 18 ont été attribués au nouvel ordre des Autolykiviridae. Ils écrivent à ce sujet dans un article publié dans la revue Nature.
Le nom du groupe fait référence au héros de la mythologie grecque Autolycus, un voleur rusé qui est aussi difficile à attraper que ces virus. «Les virus les plus courants sur Terre sont les virus infectant les bactéries contenant de l'ADN double brin», écrivent Poltz et ses co-auteurs. «Cependant, les Caudovirales à virus à queue, qui dominent les bases de données et les collections de cultures, ne sont pas représentatifs de leur présence dans l'environnement. En fait, les virus sans queue dominent les échantillons d'eau."
Cellules bactériennes infectées par des autolykiviridae / phages MIT, Kauffman et al., 2018.
Bactériophages «sans queue» Les Autolykiviridae se distinguent par une petite taille de génome - seulement environ 10 000 bases, 4 à 5 fois moins que chez les parents «à queue». Leur capacité à infecter et à tuer les cellules bactériennes était également inhabituelle. Si les phages ordinaires dans les expériences, en règle générale, affectaient une espèce spécifique de vibrions, ceux-ci infectaient en moyenne quatre et conduisaient à une mort cellulaire sensiblement plus élevée. «Ils se sont avérés responsables de 40 pour cent des décès bactériens, alors qu'ils représentaient environ 10 pour cent du nombre total de virus dans l'échantillon», explique l'un des auteurs de l'ouvrage.
Les bactéries Vibrio de différentes espèces sont situées le long du périmètre du diagramme; les cercles des virus les infectant leur sont associés: bleu - bactériophages "à queue", orange - Autolykiviridae "sans queue" / MIT, Kauffman et al., 2018.
Ces chiffres indiquent le grand rôle que joue le nouveau groupe Autolykiviridae dans la régulation des populations bactériennes et dans la biosphère dans son ensemble. Les scientifiques sont convaincus que leur technique aidera à trouver des virus qui ont précédemment échappé à la détection dans le sol, et peut-être dans l'intestin humain. Des séquences génétiques similaires se retrouvent en effet dans les génomes de bactéries de la microflore humaine.
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Sergey Vasiliev
