Les participants du consortium Genome 10K à la conférence annuelle, qui se déroule actuellement à New York, ont annoncé le lancement du projet international "Vertebrate Genomes", dont la tâche est de collecter les génomes des 66 mille espèces de vertébrés vivant sur la planète aujourd'hui. Gizmodo en dit plus sur les buts et objectifs du projet.
En 2009, les biologistes américains David Haussler, Oliver Ryder et Stephen O'Brien ont fondé le projet Genome 10K, dont le but était de séquencer 10 000 génomes de vertébrés. Au départ, 55 scientifiques de grands zoos, centres de recherche et musées ont participé au projet. Au début, on ne savait pas combien de temps il faudrait pour assembler des génomes de qualité suffisante. Mais avec le coût et la simplification des méthodes de séquençage, il est devenu clair que le projet terminerait ses tâches en quelques années. Au cours des trois dernières années, les participants au projet ont comparé les principales technologies de séquençage de l'ADN et d'analyse des résultats obtenus afin de choisir celle qui créera des «génomes de platine».
Hier, les membres de Genome 10K ont annoncé le lancement d'un nouveau projet sur le génome des vertébrés, qui vise à collecter les génomes mâles et femelles de 66 000 espèces de vertébrés. Le projet impliquera 150 scientifiques représentant 50 organisations de 12 pays. Selon l'un des fondateurs du projet, Oliver Ryder, en conséquence, les biologistes seront en mesure de comprendre les raisons de l'extinction des espèces, y compris s'il y a eu des croisements étroitement liés dans l'histoire de l'espèce, des «goulots d'étranglement», à la suite desquels la diversité génétique de l'espèce ou des suppressions - des mutations qui peuvent «s'éteindre» »Gènes nécessaires à la survie de l'organisme.
Parallèlement à l'annonce du nouveau projet, les scientifiques ont immédiatement présenté les premiers résultats de ses travaux: les génomes de 15 espèces de vertébrés, dont le perroquet kakapo en voie de disparition, endémique de Nouvelle-Zélande, et l'ornithorynque australien. Ces génomes et tous les autres génomes que les chercheurs envisagent de collecter seront publiés dans le domaine public, dans la base de données génomique de Noah's Ark.
Les participants prévoient de séquencer de courtes sections d'ADN génomique et d'en recueillir des séquences de plus en plus longues jusqu'au chromosome entier, puis de les «coller» à l'aide d'algorithmes spécialement développés pour le projet.
Auparavant, les chercheurs pouvaient lire le génome d'une personne sur un séquenceur de poche de la taille d'un smartphone. L'appareil a établi le record de la lecture la plus longue d'une molécule d'ADN, il était capable de séquencer des séquences jusqu'à 882 mille paires de bases.
Ekaterina Rusakova
