Rapport sur les résultats de l'analyse génétique d'échantillons de tissus de momies trouvées au Pérou. Ce rapport a été préparé en novembre 2018.
Interprètes
- Laboratoires CEN4GEN (6756 - 75 Street NW Edmonton, AB Canada T6E 6T9) - Préparation et séquençage des échantillons.
- ABRAXAS BIOSYSTEMS SAPI DE CV (Mexique) - analyse de données informatiques.
Après une analyse préliminaire de la qualité, 3 échantillons ont été prélevés sur 7 échantillons soumis pour une analyse plus approfondie.
Échantillons pour analyse
| La désignation | nom d'origine | Nom conditionnel | Image |
| Ancien-0002 | Cou Bone Med Assis 00-12 Victoria 4 | Victoria | Fig. 3.117 |
| Ancien-0003 | 1 main 001 | Main séparée avec 3 doigts | Graphique 3.118 |
| Ancien-0004 | Momia 5 - ADN | Victoria | Fig. 3.117 |
Pour ces échantillons, les opérations suivantes ont été effectuées:
Vidéo promotionelle:
- Extraction d'ADN.
- Contrôle de la qualité de l'ADN.
- Multiplication de l'ADN.
- Création d'une bibliothèque d'ADN.
- Séquençage ADN.
- Formation de données séquencées purifiées.
- Contrôle de qualité.
- Analyse préliminaire par superposition de lectures d'ADN sur le génome humain.
- Analyse pour l'isolement de courtes lectures d'ADN typiques de l'ADN ancien.
- Superposition des lectures d'ADN de Ancient0003 sur les bibliothèques de génome humain existantes.
- Analyse mitochondriale pour la détection des variantes de la boucle D et d'autres sites informatifs pour la détermination des haplotypes mitochondriaux.
- Détermination du sexe des échantillons Ancient0003.
- Identification d'éventuels organismes étrangers dans les échantillons.
- Analyse des bases de données ADN pour identifier les similitudes avec les organismes connus.
Graphique 3.117. Extraire des échantillons du cou de Victoria.
Pour identifier les types possibles d'organismes présents dans les échantillons Ancient0004 et Ancient0002 (Victoria), un croquis d'ADN génomique a été réalisé (Ondov et al., 2016), dans lequel des groupes de fragments courts, k-mers, ont été comparés aux bases de données disponibles. Le logiciel BBTools a été utilisé.
Les organismes suivants ont été testés:
- Les bactéries.
- Virus.
- Plasmides.
- Phages.
- Champignons.
- Plastid.
- Les diatomées.
- Humain.
- Bos Taurus.
- H penzbergensis.
- PhaseolusVulgaris.
-
Mix2: étiquette pour les génomes suivants:
- Chloroplaste de Lotus japonicus, génome complet.
- Canis lupus familiaris cOR9S3P récepteur olfactif de la famille 9 du pseudogène de la sous-famille S (cOR9S3P) sur le chromosome 25.
- Mitochondrie Vigna radiata, génome complet.
- Chloroplaste de Millettia pinnata, génome complet.
- Curvibacter lanceolatus ATCC 14669 F624DRAFT_scaffold00015.15, séquence de fusil de chasse du génome entier.
- Asinibacterium sp. OR53 scaffold1, séquence de fusil de chasse du génome entier.
- Souche LK28 32 de Bacillus firmus, séquence de fusil de chasse du génome entier.
- Chloroplaste de Bupleurum falcatum, génome complet.
- Alicycliphilus sp. B1, séquence de fusil de chasse du génome entier.
- Bacillus litoralis souche C44 Scaffold1, séquence de fusil de chasse du génome entier.
- Chryseobacterium takakiae souche DSM 26898, séquence de fusil de chasse du génome entier.
- Paenibacillus sp. FSL R5-0490.
- Souche DSM 25387 de Bacillus halosaccharovorans Scaffold3, séquence de fusil de chasse du génome entier.
- Bactérie Rhodospirillales URHD0017, séquence de fusil de chasse du génome entier.
- Souche 10J4 10J4_trimmed_contig_26 de Bacillus onubensis, séquence de fusil de chasse du génome entier.
- Radyrhizobium sp. MOS004 mos004_12, séquence de fusil de chasse du génome entier.
- Bacillus sp. UMB0899 ERR1203650.17957_1_62.8, séquence de fusil de chasse du génome entier.
-
Vertébrés: étiquette pour les génomes suivants:
- Amblyraja-radiata_sAmbRad1_p1.fasta.
- bStrHab1_v1.p_Kakapo.fasta.
- bTaeGut1_v1.p_ZebraFinch.fasta.
- GCA_000978405.1_CapAeg_1.0_genomic_CapraAegagrus.fna.
- GCA_002863925.1_EquCab3.0_genomic_Horse.fna.
- GCF_000002275.2_Ornithorhynchus_anatinus_5.0.1_genomic.fna.
- GCF_000002285.3_CanFam3.1_genomic.fna.
- Macaco_GCF_000772875.2_Mmul_8.0.1_genomic.fna.
- rGopEvg1_p1_Gopherus_evgoodei_tortuga.fasta.
- Protozoaires.
Graphique 3.118. Image et radiographie de deux mains à trois doigts.
Après tous les filtres, 27974521 lectures pour Ancient0002 et 304785398 lectures pour Ancient0004 ont été reçues. Cela montre que 27% de l'ADN de l'échantillon Ancient0002 et 90% de l'ADN de l'échantillon Ancient0004 ne peuvent pas être identifiés avec les échantillons d'ADN des organismes analysés dans les bases de données disponibles.
L'étape suivante de l'analyse a été réalisée à l'aide du logiciel megahit v1.1.3 (Li et al., 2016). Le résultat suivant a été obtenu:
- Ancient0002: 60852 contigs, total 50459431 bp, min 300 bp, max 24990 bp, moy 829 bp, N50 868 bp, 884,385 (5,39%) lectures assemblées.
- Ancient0003: 54273 contigs, total 52727201 bp, min 300 bp, max 35094 bp, avg 972 bp, N50 1200 bp, 20247568 (65,69%) lectures assemblées.
Le résultat de l'analyse est indiqué sur la figure.
Graphique 3.116. Rapport des lectures classifiées pour 28073655 lectures Ancient0002 (graphique du haut) et 25084962 lectures Ancient0004 (graphique du bas) par rapport à la base ADN 34904805 représentant 1109518 groupes taxonomiques.
Conclusion
À la suite de l'analyse, il a été montré que les échantillons Ancient0002 et Ancient0004 (Victoria) ne correspondent pas au génome humain, tandis que l'échantillon Ancient0003 correspond bien à celui de l'homme.
Commentaire de Korotkov K. G
Notez que la main à trois doigts appartenait à une grande créature, de taille comparable à Maria, et le résultat obtenu correspond au résultat de l'analyse ADN de Maria. Victoria est un représentant des «petites créatures», et le résultat montre que leur ADN ne correspond à aucune créature terrestre moderne. Naturellement, nous ne disposons pas de données sur les créatures anciennes qui ont disparu depuis des millions d'années.
Liens
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Matériel fourni par Konstantin Georgievich Korotkov (docteur en sciences techniques, professeur, Université des technologies de l'information, de la mécanique et de l'optique) et Dmitry Vladislavovich Galetsky (candidat en sciences médicales, I. P. Pavlov First St. Petersburg State Medical University)